في هذا المشروع قمت بإجراء تحليل مقارن للجينومات الخاصة بفيروس Variola بهدف دراسة الاختلافات الجينية بين السلالات المختلفة وفهم العلاقات التطورية بينها. بدأت العمل بالبحث عن تسلسلات الجينوم المناسبة واستخراجها من قواعد البيانات الحيوية مثل NCBI، ثم قمت بمعالجة البيانات وتحويلها إلى صيغة FASTA لاستخدامها في التحليل الحيوي.
بعد ذلك أجريت Multiple Sequence Alignment باستخدام أداة MAFFT لمقارنة التسلسلات الجينية وتحديد مناطق التشابه والاختلاف بينها. كما قمت ببناء شجرة تطورية (Phylogenetic Tree) باستخدام FastTree لتحليل العلاقات التطورية بين السلالات المختلفة للفيروس.
قمت أيضًا بإنشاء pipeline باستخدام Bash scripting لأتمتة خطوات تحميل البيانات وتنظيف التسلسلات ومعالجتها قبل التحليل، مما ساعد على تسريع سير العمل وتقليل الأخطاء أثناء معالجة البيانات.
من خلال هذا المشروع طورت خبرة عملية في Comparative Genomics وتحليل التسلسلات الحيوية واستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية لاستخلاص رؤى علمية حول التطور الفيروسي والعلاقات الجينية بين السلالات المختلفة.
الأدوات والتقنيات المستخدمة
NCBI Databases
FASTA sequence processing
MAFFT (Multiple Sequence Alignment)
FastTree (Phylogenetic Tree Construction)
Bash scripting
Bioinformatics pipelines
Comparative Genomics analysis
